More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3306 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
178 aa  357  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  73.03 
 
 
178 aa  271  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.98 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.41 
 
 
180 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.28 
 
 
180 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.28 
 
 
180 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.28 
 
 
180 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.28 
 
 
180 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 
182 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.42 
 
 
178 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 
180 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
182 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.78 
 
 
182 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  29.48 
 
 
180 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 
175 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  30.81 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  34.1 
 
 
217 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
182 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  34.16 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  31.14 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  30.73 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
178 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
179 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
177 aa  88.2  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.38 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.73 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  29.24 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.43 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.55 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.07 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  33.89 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.98 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  32.56 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  27.75 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.98 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.06 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.47 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>