More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3153 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 181 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.67 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.28 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.48 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  39.31 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  38.07 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17830  ATP synthase F1, delta subunit  42.77 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  42.59 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.06 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.47 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.08 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.08 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.08 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.08 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.08 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.84 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.36 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.99 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.34 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.5 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  35.76 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.02 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  36 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.73 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  33.52 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  34.1 
 
 		 217 aa  95.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  30.73 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  32.56 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.21 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.79 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 		 177 aa  87.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>