More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6638 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
190 aa  361  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  90 
 
 
190 aa  337  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  77.89 
 
 
189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  74.21 
 
 
189 aa  272  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  75.79 
 
 
190 aa  269  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  73.18 
 
 
179 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.89 
 
 
186 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.89 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.11 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.54 
 
 
186 aa  208  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.66 
 
 
186 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.54 
 
 
186 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.44 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  56.35 
 
 
201 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.86 
 
 
188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.86 
 
 
188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  53.3 
 
 
194 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.27 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.09 
 
 
186 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.09 
 
 
186 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.41 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.96 
 
 
193 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.36 
 
 
188 aa  168  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  50.28 
 
 
188 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  51.14 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  42.08 
 
 
186 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  44.26 
 
 
186 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  44.26 
 
 
186 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.93 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.65 
 
 
184 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  40.44 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  37.7 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  43.17 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.8 
 
 
186 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  42.25 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
197 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.42 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  38.37 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  38.76 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.91 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  39.08 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.28 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
179 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.05 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
184 aa  92  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.66 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
183 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.98 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.79 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  24.86 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.27 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.88 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.69 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  32.76 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  27.53 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>