163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4015 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 274 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  89.78 
 
 		 274 aa  427  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  50.18 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.12 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  42.8 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  42.97 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  41.25 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  44.58 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  41.42 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.32 
 
 		 269 aa  165  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  42.8 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  43.08 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  41.15 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  38.29 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  38.52 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.86 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  40.3 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  41.64 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.74 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.92 
 
 		 445 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  37.24 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 449 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.63 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.63 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.63 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.67 
 
 		 445 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  37.34 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  36.18 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.07 
 
 		 448 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  32.55 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.59 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  34.9 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  37.69 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.35 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34.84 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  29.45 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  34.04 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.55 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.88 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.35 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  37.27 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  37.27 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.12 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  36.26 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.62 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  31.65 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  26.52 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  35.14 
 
 		 180 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.1 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.68 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  27.56 
 
 		 185 aa  53.9  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  35.92 
 
 		 197 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.44 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.26 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.16 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.26 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.1 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  42.03 
 
 		 118 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.14 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  34.78 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  34.92 
 
 		 184 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.34 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>