114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1798 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 288 aa  541  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  27.54 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.08 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.6 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.95 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.22 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  26.1 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  33.76 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.6 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  26.34 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  24.7 
 
 		 179 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.95 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.6 
 
 		 182 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  27.18 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.42 
 
 		 188 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 179 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 183 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  29.53 
 
 		 449 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 		 179 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  27.99 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 180 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  27.15 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  33.12 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.6 
 
 		 180 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.17 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.61 
 
 		 180 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.75 
 
 		 182 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.75 
 
 		 182 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 		 178 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  27.81 
 
 		 183 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  35.48 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.34 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  29.68 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  18.56 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.16 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  25.93 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.07 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.57 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  26.97 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  28.48 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.34 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 		 183 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 182 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 		 179 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  26.53 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 186 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 180 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0149  ATP synthase F1, delta subunit  21.59 
 
 		 179 aa  46.6  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  19.39 
 
 		 175 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  38.46 
 
 		 188 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  31.72 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  20.12 
 
 		 175 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  36.51 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.57 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.85 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  21.89 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.17 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  23.65 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  33.87 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>