294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1268 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  87.9 
 
 
158 aa  277  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  50.43 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  52.63 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  41.35 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  41.35 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  41.35 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.85 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  41.18 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  40.45 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.86 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  34.26 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.58 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.57 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.11 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.58 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.98 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.94 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.98 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.65 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.06 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.98 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.43 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.64 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.42 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
177 aa  63.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  35.23 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.08 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.02 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  32.77 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.91 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.03 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  34.94 
 
 
209 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  34 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.51 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  34.44 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.11 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.89 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.51 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.38 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.71 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.66 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.66 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  34.82 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.66 
 
 
178 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  30.84 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.66 
 
 
188 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.63 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  32.37 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  43.08 
 
 
273 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.05 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.66 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.58 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.43 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
445 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.08 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.67 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  42.42 
 
 
275 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  29.75 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
217 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.17 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.88 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.45 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  35.24 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.45 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.46 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.45 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.68 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.43 
 
 
271 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.88 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.31 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
446 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  33.68 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  30.69 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.69 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.76 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>