228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1621 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1621  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
182 aa  346  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0670992  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1015  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.52 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.95 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.52 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  26.42 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.31 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.17 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.07 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.11 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.11 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.02 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.34 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.36 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.61 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  21.47 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  26.88 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.17 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.82 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.82 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.39 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.17 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.04 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.87 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.23 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  22.64 
 
 
186 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.83 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  22.64 
 
 
186 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.09 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.22 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.47 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  25.6 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  20.78 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.49 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.03 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.91 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  24.84 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  21.38 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.31 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  25.17 
 
 
197 aa  58.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.4 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.49 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.19 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  27.08 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.4 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.31 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  23.27 
 
 
186 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  26.42 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  23.18 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.64 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  27.46 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  21.97 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  23.29 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.67 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.51 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  34.12 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.62 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.1 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.74 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  26.67 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  23.33 
 
 
217 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.46 
 
 
175 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  23.4 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.21 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  21.94 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.86 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.1 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.94 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.13 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.57 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.07 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  26.92 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>