77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1015 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1015  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
182 aa  343  6e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1621  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0670992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  28.81 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  24.43 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  24.43 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.31 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  27.07 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.56 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0149  ATP synthase F1, delta subunit  28.14 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  23.56 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.3 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  24.43 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  22.86 
 
 
211 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  25.27 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.57 
 
 
180 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  21.3 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.18 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  22.73 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.84 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  25.7 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  33.02 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.58 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  30.7 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  23.89 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.46 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  26.53 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  23.29 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  19.65 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.26 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.08 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.89 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.89 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.94 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.65 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.65 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.65 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  22.29 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
178 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.69 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
177 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.71 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
177 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
177 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.34 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.3 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
177 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
178 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.13 
 
 
180 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.13 
 
 
180 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.4 
 
 
179 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  26.55 
 
 
178 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.11 
 
 
175 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.42 
 
 
182 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  23.56 
 
 
185 aa  42  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.02 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.62 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.86 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.69 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.53 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.84 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.62 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.77 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>