93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1110 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  53.65 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  47.35 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  47.44 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  46.77 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  47.47 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  48.98 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  46.64 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  43.24 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  44.88 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  51.25 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  48.78 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  34.4 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  32.3 
 
 		 347 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  33.19 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  44.1 
 
 		 172 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  38.8 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  38.1 
 
 		 244 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  37.57 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  37.97 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  35.42 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  34.92 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  34.39 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  30.14 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  30.81 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 		 810 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 878 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.34 
 
 		 764 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 637 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 739 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 632 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.02 
 
 		 622 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 681 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 576 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.19 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.71 
 
 		 585 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.26 
 
 		 865 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.89 
 
 		 730 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.75 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 620 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.44 
 
 		 725 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 714 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 754 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.04 
 
 		 714 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 583 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 1406 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 824 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 864 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 688 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 689 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 505 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.47 
 
 		 780 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 685 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.27 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1450 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.74 
 
 		 661 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.65 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 566 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 1252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 750 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.7 
 
 		 560 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1197 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 1252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 754 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.61 
 
 		 816 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  26.4 
 
 		 508 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 448 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  34.74 
 
 		 669 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1085 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.24 
 
 		 681 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 448 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 789 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 822 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>