25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3703 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  58.22 
 
 		 231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  59.38 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  58.77 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  56.64 
 
 		 267 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  60.3 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  60.8 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  39.63 
 
 		 317 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  40.44 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 339 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  41.1 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  36.02 
 
 		 342 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  32.14 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  33.33 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 		 314 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  31.75 
 
 		 330 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  25.89 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  27.23 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  23.64 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  21.86 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  24.86 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>