26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2693 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  84.42 
 
 		 231 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  59.31 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  53.74 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  54.88 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  58.71 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  57 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  42.11 
 
 		 317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  38.07 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  38.54 
 
 		 292 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  38.92 
 
 		 172 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  33.64 
 
 		 332 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  31.9 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  34.45 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  31.66 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  32.08 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  95.5  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  26.05 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  27.72 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  23.98 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  25 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  23.89 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>