40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  85.66 
 
 		 326 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  66.08 
 
 		 317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  52.79 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  48.25 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  42.71 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  47.06 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  52.46 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  49.81 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  43.22 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  43.57 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  59.76 
 
 		 172 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  41.32 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  34.56 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  33.57 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  35.68 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  40.45 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  39.89 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  38.54 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  39.25 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  39.68 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  34.03 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  31.86 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  20.14 
 
 		 164 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 475 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  30 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.87 
 
 		 725 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  29.46 
 
 		 1717 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  30.43 
 
 		 748 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.76 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.37 
 
 		 622 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  36.23 
 
 		 625 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  26.35 
 
 		 199 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>