27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2426 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  84.42 
 
 		 231 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  60.28 
 
 		 224 aa  266  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  56.81 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  59.2 
 
 		 244 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  57.29 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  53.49 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  41.75 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 326 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  39.68 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 339 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  38.37 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  34.12 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  31.55 
 
 		 337 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  33.82 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  32.35 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  32.16 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  34.5 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  26.05 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  27.17 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  24.51 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  23.4 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  25.95 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  23.61 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  36.05 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>