32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1043 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  49.23 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  42.02 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  34.58 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  34.56 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  33.88 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  31.86 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  35.43 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  32.65 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  31.17 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  33.58 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  33.95 
 
 		 172 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  31.98 
 
 		 188 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  26.41 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  27.23 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  25.26 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  25.12 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  29.07 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  25.58 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  24.26 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  23.98 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  24.51 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  30.43 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1134 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0069  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  26.03 
 
 		 199 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>