17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1490 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  26.62 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  27.01 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.49 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  26.01 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  26.01 
 
 		 322 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1108  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.894333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  24.83 
 
 		 347 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  23.14 
 
 		 734 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  23.14 
 
 		 734 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  23.14 
 
 		 521 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  26.8 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  23.58 
 
 		 716 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  26.4 
 
 		 342 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  28.76 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>