56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1108 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1108  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.894333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.28 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 927 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  24.56 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 4079 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 615 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.99 
 
 		 417 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.03 
 
 		 733 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.23 
 
 		 560 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 878 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.23 
 
 		 1694 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2526  hypothetical protein  27.91 
 
 		 151 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.872356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 620 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 836 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 810 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.89 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  32 
 
 		 594 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  33.68 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1276 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1134 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3823  hypothetical protein  46.51 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.65 
 
 		 816 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 466 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 632 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 543 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  23.36 
 
 		 164 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.76 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 762 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.02 
 
 		 1979 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 465 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 		 743 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 466 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 503 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 605 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 581 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 955 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 637 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 602 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 		 1056 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.29 
 
 		 706 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  29.47 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 465 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>