107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1122 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 343 aa  679    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  48.15 
 
 		 331 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  42.22 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  44.86 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  39.01 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  37.01 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  34.72 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  34.15 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  34.94 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  33.03 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  35.67 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  32.05 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  32.92 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  29.55 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  32.42 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  30.42 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  30.06 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  31.19 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  27.49 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  29.43 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  30.93 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  28.45 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  28.95 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  28.91 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  28.91 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  28.91 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  31.99 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  27.91 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  27.84 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  25.46 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.91 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  28.43 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  28.33 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0269  transcriptional regulator protein-like protein  21.78 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.81 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  40.28 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  40.28 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  40.28 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  30.94 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  40.28 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.74 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  33.09 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.06 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  32.37 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.36 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  26.14 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  25.95 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  26.49 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  21.43 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.07 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.39 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.3 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  25.26 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  24.24 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.24 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.42 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.4 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  27.19 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.91 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  25.27 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  29.67 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.55 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2933  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.93 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.64 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.93 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.76 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.03 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.73 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  32.53 
 
 		 180 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.03 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  24.69 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.69 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.99 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.25 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  25.13 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.49 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.27 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.47 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2496  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.74 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2252  transcriptional regulator protein-like protein  24.01 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  25.73 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2155  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.85 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.57 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.47 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  25.99 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.91 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  30.43 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.17 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>