241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0573 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
317 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  47.65 
 
 
330 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.99 
 
 
334 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  38.75 
 
 
323 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  38.75 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  31.85 
 
 
324 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  32.82 
 
 
339 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.85 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  32.09 
 
 
351 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.23 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  29.43 
 
 
326 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.5 
 
 
347 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  29.75 
 
 
337 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.3 
 
 
327 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  28.21 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  28.08 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  37.62 
 
 
229 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  28.48 
 
 
326 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  26.9 
 
 
323 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.27 
 
 
333 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.39 
 
 
333 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.14 
 
 
319 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.25 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.01 
 
 
330 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.31 
 
 
327 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  31.07 
 
 
336 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 
334 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  29.79 
 
 
334 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.52 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.17 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  29.09 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.14 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  28.53 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  28.52 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.14 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  35.12 
 
 
334 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  28.13 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.69 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.06 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.33 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.78 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.72 
 
 
336 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.05 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.38 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  27.35 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.99 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.59 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.05 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.35 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.84 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.54 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  24.32 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.28 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  22.02 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.55 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  24.84 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.4 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.96 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  26.41 
 
 
687 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.18 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  28.19 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.16 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  30.95 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  24.77 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  30.98 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.24 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  23.56 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  23.69 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  23.6 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.53 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  23.15 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  22.53 
 
 
313 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.28 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.08 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2026  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.57 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826373  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  21.84 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.04 
 
 
233 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  18.46 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  18.46 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  18.15 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  22.93 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.89 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.41 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.88 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.21 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  31.2 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  18.15 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  21.59 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.5 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.93 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.51 
 
 
229 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.74 
 
 
233 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.25 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  23.82 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.05 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  26.14 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>