More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4096 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 		 334 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  61.49 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.99 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  40.37 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  37.42 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  31.99 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  33.65 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.18 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.7 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.05 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  30.79 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.56 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.44 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  39.05 
 
 		 229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  28.04 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  28.75 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.67 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.05 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  28.1 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  28.16 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.32 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.47 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.52 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.19 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.85 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.67 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.92 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  29.72 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.39 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.95 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.93 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  25.17 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.76 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.69 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.09 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  28.31 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.42 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.39 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  31.53 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.08 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.91 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.02 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  26.77 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.32 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  27.01 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.42 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  25.17 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.46 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  23.53 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  26.73 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  26.44 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.74 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  28.83 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  26.1 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.17 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.43 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.77 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  22.05 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.77 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.43 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.43 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  31.65 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  25.93 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  22.25 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  22.02 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.07 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.13 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  26.87 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.87 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  26.01 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  24.09 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  21.8 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.1 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.08 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  28.44 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  26.9 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  31.08 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  28.33 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.33 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  31.08 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.08 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  30.17 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.05 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.78 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>