50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2910 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  100 
 
 		 359 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  52.07 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  48.66 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  47.49 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  51.04 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  34.2 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  24.13 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0570  hypothetical protein  26.05 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  24.42 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  24.25 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.38 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.83 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.25 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  24.08 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  22.55 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.23 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  22.35 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.58 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.32 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.44 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.59 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.37 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.59 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.15 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.77 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2768  hypothetical protein  48.98 
 
 		 57 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.945651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  22.07 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.15 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.64 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  20.27 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  22.91 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.14 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.25 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  23.46 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.06 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.75 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.88 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  26.32 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  22.06 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.58 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  20.78 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  22.78 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  22.46 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  23.73 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  23.27 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.7 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.26 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  21.4 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  23.42 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>