More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0382 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 		 333 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  54.38 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  56.41 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  54.85 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  53.05 
 
 		 330 aa  359  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.15 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.45 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  49.68 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.15 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.97 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.56 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.1 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.48 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  29.25 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.55 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  27.33 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  28.14 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.04 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.23 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  29.57 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.91 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.13 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.24 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.19 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.39 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.82 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.47 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  25.16 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.42 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  25 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  27.8 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.81 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  28 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  26.2 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  25.95 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  26.77 
 
 		 351 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  23.75 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  26.19 
 
 		 326 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.56 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.46 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.99 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  26.84 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  25.73 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  27.79 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.24 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  29.89 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  26.81 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2452  hypothetical protein  26.49 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.271591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.78 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.08 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  27.3 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  27.5 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1479  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.124132  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  26.4 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  24.18 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.58 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.22 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.08 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  26.46 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  23.99 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.14 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  31.54 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.07 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  29.76 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.85 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  27.81 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.05 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  23.68 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  28.74 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.256195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 1078 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.43 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  23.55 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  30.46 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  23.3 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  23.6 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  23.99 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  23.6 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  22.93 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  24.55 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  24.46 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.02 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.82 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  25.33 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.65 
 
 		 687 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  23.36 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.91 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.29 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25.78 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.68 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  28.49 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.22 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  27.03 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>