More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2474 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  97.81 
 
 
320 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  97.5 
 
 
320 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  94.06 
 
 
320 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  27.66 
 
 
313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.88 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  27.96 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  29.39 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  31.44 
 
 
323 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  27.98 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  29.28 
 
 
313 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.83 
 
 
309 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  32.41 
 
 
323 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 
233 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.43 
 
 
233 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.77 
 
 
229 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.04 
 
 
319 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.39 
 
 
317 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.63 
 
 
315 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.61 
 
 
316 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  30 
 
 
233 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.73 
 
 
319 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  25.32 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.39 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.36 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.39 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.59 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.19 
 
 
235 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.03 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.01 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.55 
 
 
232 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  28.38 
 
 
229 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.69 
 
 
320 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.78 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.73 
 
 
232 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.76 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.5 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  28.51 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  28.51 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  28.51 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  25.78 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.78 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  29.22 
 
 
230 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.55 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
231 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.64 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 
232 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.15 
 
 
237 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.23 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.11 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  27.56 
 
 
232 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  28.38 
 
 
234 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.24 
 
 
232 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.1 
 
 
299 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.15 
 
 
302 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.24 
 
 
232 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.88 
 
 
324 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.17 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
360 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.34 
 
 
228 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.65 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.32 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  29.36 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.7 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.39 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  27.6 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.6 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  30.05 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.09 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  29.69 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  29.47 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.43 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  30.05 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.76 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  29.58 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  29.73 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.93 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  28.19 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.67 
 
 
233 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.99 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.99 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  27.83 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.33 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.47 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  29.13 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.39 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.93 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.65 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.07 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.27 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.96 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.11 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>