64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2599 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 340 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  41.81 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  31.36 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2452  hypothetical protein  28.87 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.271591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.67 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  24.58 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  25.52 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.44 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.76 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.95 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.06 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.61 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  23.3 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  37.8 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.78 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  22.39 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  24.12 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.3 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.44 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  22.54 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.53 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.11 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  21.52 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.21 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.73 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  23.28 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.66 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.17 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.71 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.68 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  23.35 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.58 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.08 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  22.51 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.256195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  25.56 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  23.84 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  31.96 
 
 		 1084 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.81 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  21.92 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  23.81 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.39 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.23 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  24.19 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  22.01 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  20.81 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.78 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  21.21 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  27.66 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  29.84 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  25.08 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  21.97 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  21.05 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  22.49 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.08 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.11 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  23.12 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.71 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>