More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1233 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  100 
 
 
326 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  49.23 
 
 
326 aa  351  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  48.92 
 
 
337 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  49.54 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.32 
 
 
327 aa  322  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.92 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  45.87 
 
 
351 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  33.85 
 
 
336 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  34.47 
 
 
330 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.43 
 
 
347 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  29.15 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.08 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.04 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  28.57 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.04 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.48 
 
 
317 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.8 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  26.35 
 
 
323 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  36.93 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.41 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 
333 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.63 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.38 
 
 
323 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.25 
 
 
327 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  32.09 
 
 
229 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.47 
 
 
334 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.47 
 
 
326 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25.32 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  24.14 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.27 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.38 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  26.56 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.84 
 
 
312 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.55 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  26.22 
 
 
336 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.68 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  25.24 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.07 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.97 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.19 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  26.58 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.86 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  21.9 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.1 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.71 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  25.6 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  25.37 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.46 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  24.29 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  22.63 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.53 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  25.96 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  22.63 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.75 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  23.24 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  30.92 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.27 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  28.3 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.68 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  28.3 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  28.3 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  37.65 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.65 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.15 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  25.96 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  24.93 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.23 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  28.84 
 
 
232 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 
227 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.93 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  27.08 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.22 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  25.96 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.65 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5701  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.49 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818045  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.84 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.18 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  23.3 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  27.98 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.98 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  29.47 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  28.17 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  26.94 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.34 
 
 
232 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.85 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  32.56 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  21.01 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.79 
 
 
230 aa  63.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>