69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0239 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 330 aa  689    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  31.07 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  31.27 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.18 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.75 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.81 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  26.46 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.42 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2452  hypothetical protein  26 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.271591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.22 
 
 		 351 aa  85.9  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.55 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.89 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.57 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.3 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.13 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  23.79 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.05 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  33.05 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.54 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.02 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.56 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  23.89 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1479  transcriptional regulator  24.36 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.124132  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.84 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  29.09 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  22.97 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.16 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  25.36 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  24.08 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.57 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  26.49 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  23.03 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0512  regulatory protein, DeoR  25.28 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  24.23 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  22.37 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  30.13 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  22.58 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.55 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  23.26 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3359  hypothetical protein  22.57 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.737744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.44 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.62 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  27.27 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  28.66 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  22.64 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  31.71 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  22.81 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2986  hypothetical protein  23.55 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.178567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  21.62 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  24.26 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  25.95 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  23.27 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  26.17 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0351  hypothetical protein  21.48 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  22.54 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  22.92 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.38 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  24.79 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  26.86 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.21 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  24.05 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1228  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.95 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.671066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.56 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  20.6 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>