77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2568 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 352 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  50 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  39.7 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  37.65 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  39.01 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  40.25 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  36.06 
 
 		 335 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  34.85 
 
 		 335 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  35.74 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  34.05 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  32.05 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  30.88 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  33.44 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  31.38 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  32.82 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  31.47 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  33.03 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  32.15 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  30.57 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  30.93 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  29.47 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  28.85 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  28.16 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  30.49 
 
 		 301 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  26.13 
 
 		 346 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  26.43 
 
 		 363 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  26.58 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  23.51 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.72 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  24.9 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.58 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  23.41 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.55 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  21.49 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.31 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.28 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.69 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  22.9 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.93 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.68 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  24.6 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.65 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  35.07 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  25.71 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  41.89 
 
 		 187 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  41.89 
 
 		 201 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  41.33 
 
 		 209 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.29 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.7 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.08 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  25.37 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  22.95 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  23.27 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  26.52 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  27.42 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.73 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.38 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.38 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  34.25 
 
 		 180 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.29 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.04 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.59 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.15 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  21.05 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.9 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  37.5 
 
 		 184 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  37.8 
 
 		 180 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>