30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2212 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  79.78 
 
 		 184 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  79.21 
 
 		 187 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  76.54 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  43.78 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  44.83 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  43.68 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  43.68 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  42.99 
 
 		 343 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  40.5 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  37.5 
 
 		 331 aa  64.3  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  36.7 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  43.75 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  42.25 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  38.04 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  41.18 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  35.46 
 
 		 355 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  36.49 
 
 		 336 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  34.04 
 
 		 378 aa  52  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  36.21 
 
 		 383 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  40.26 
 
 		 344 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  32.53 
 
 		 343 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  35.82 
 
 		 330 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  30.88 
 
 		 335 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  34.25 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  26.87 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>