96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1304 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 335 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  88.86 
 
 		 335 aa  611  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  36.83 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  36.89 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  34.91 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  35.2 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  36.06 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  34.15 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  31.63 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  29.81 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  33.99 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  31.15 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  31.03 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  31.45 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  30 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  31.83 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  33.22 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  30.42 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  28.13 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  30.1 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  29.02 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  28.76 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  29.21 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  27.99 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  26.28 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  26.51 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  26.51 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  29.63 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.22 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  25.3 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.55 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  27.4 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  24.7 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.14 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.85 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.42 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  27.54 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  36.78 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.55 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.84 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.06 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  22.81 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.91 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  36.25 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  36.25 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  36.25 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.66 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.05 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25.41 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 1078 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  24.15 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  25.66 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  24.54 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  21.05 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  23.85 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.84 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.63 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.56 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.01 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.88 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.89 
 
 		 321 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.49 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.18 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.53 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.01 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2933  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.21 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  23.33 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  22.39 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  22.61 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  22.39 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  23.21 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  31.08 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  33.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.61 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.22 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  21.97 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.13 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  30.88 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  21.67 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  21.84 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  31.03 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0452  helix-turn-helix type 11 domain protein  26.74 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.94 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.12 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.32 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.59 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.51 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  22.16 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  22.99 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>