48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001847 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  51.86 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  48.87 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  47.67 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  35.97 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  34.11 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  31.48 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  31.44 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  33.44 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  30.45 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  30.1 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  32.15 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  31.83 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  32.15 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  28.39 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  30.69 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  28.85 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  30.84 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  29.15 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  29.37 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  28.95 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  27.55 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  28.48 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  25.95 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  25.84 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  25.84 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  25.84 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  26.88 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  23.99 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  29.23 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  26.37 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  25.1 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.54 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  27.68 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.87 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  23.87 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.49 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  20.94 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  32.05 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.78 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5442  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.89 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.9 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.77 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>