32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02534 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  100 
 
 		 346 aa  714    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  36.75 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  36.75 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  36.75 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  32.74 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  28.95 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  31.47 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  32.39 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  30.12 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  29.6 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  28.45 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  26.13 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  27.16 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  27.69 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  25.95 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  28.12 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  26.79 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  27.16 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  26.47 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  26.52 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  26.38 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  26.39 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  25.92 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  25.23 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  24.7 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  23.87 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  26.07 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  24.24 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  24.01 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  28.98 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  28.98 
 
 		 187 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  34.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>