133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1283 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 333 aa  668    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  46.57 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  45.05 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  44.85 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  39.88 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  38.15 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  37.84 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  37.88 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  34.65 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  35.84 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  40 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  37.69 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  34.64 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  34.85 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  37.06 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  30.72 
 
 		 347 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  34.27 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  35.44 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  32.52 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  32.63 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  31.75 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  30.84 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  29.03 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  29.6 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  27 
 
 		 331 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  27 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  26.71 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  29.22 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  30.14 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  28.86 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.57 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.44 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  21.32 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.77 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  22.68 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.33 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  26.36 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.61 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  24.62 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.29 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  19.75 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.88 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  27.07 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1479  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.124132  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.31 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25.89 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.81 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.78 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.32 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  38.04 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.54 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  27.86 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.71 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  19.7 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  42.05 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.78 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  42.05 
 
 		 201 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  24.72 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3752  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.34 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0372442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  34.78 
 
 		 180 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.72 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.57 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  43.02 
 
 		 187 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.07 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.26 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  31.52 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.76 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  20.95 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  25.13 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.44 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.05 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.4 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.64 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  28.86 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  42.86 
 
 		 185 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  23.64 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.69 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  39.39 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.41 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  25.95 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  36.47 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3508  hypothetical protein  23.53 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.59 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  26.84 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  29.84 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.87 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2496  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.86 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.64 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1028  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.45 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  26.43 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.05 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  20.95 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.71 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>