90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1479 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1479  transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.124132  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5442  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  36.45 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0351  hypothetical protein  31.96 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  28.12 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.73 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.45 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.75 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.24 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.73 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.43 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  29.92 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.42 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  27.53 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  28.66 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.21 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3508  hypothetical protein  28.8 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.380586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  31.47 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.1 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.61 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  26.83 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  25.94 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.71 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  32.28 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.89 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.23 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.23 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.54 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  25.65 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  24.36 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  31.15 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  30.48 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.18 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2986  hypothetical protein  27.12 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.178567 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  26.23 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  26.16 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  17.95 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.96 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.65 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.21 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.76 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  30.23 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4107  hypothetical protein  37 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.408855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.86 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.14 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.78 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.93 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.57 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.49 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  31.49 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  31.43 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.08 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.43 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  21.91 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  25.6 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.11 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.92 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.75 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  28.05 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  22.31 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  26.01 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  17.48 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.92 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.8 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  17.8 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.09 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  18.12 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.16 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.01 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.96 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.79 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.42 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.03 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.43 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  23.75 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  19.46 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>