More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1047 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  64.65 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  61.71 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  58.81 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  59.47 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.89 
 
 		 327 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  58.58 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  57.14 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.22 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  50.83 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  55.05 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  50.17 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  50.17 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  54.82 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.02 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  53.53 
 
 		 320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.83 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  55.48 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.32 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  47.52 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.54 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  47.68 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.07 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.46 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.78 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4787  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  46.04 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  46.03 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.62 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.9 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.44 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.31 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.14 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.82 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0153  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.15 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.82 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.18 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.15 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.37 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2888  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.67 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.54 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  44.97 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.62 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.44 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.44 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.18 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.47 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0728  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.61 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00443  repressor  36.04 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  34.09 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  41.41 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  36.53 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.48 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.7 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.02 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.36 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.32 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.8 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.59 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.05 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  33.44 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  31.73 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3440  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.74 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000171457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  32.41 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.84 
 
 		 228 aa  99.4  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.19 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.58 
 
 		 229 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0831  transcriptional regulator-like  37.67 
 
 		 244 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0455803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.1 
 
 		 242 aa  95.9  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  27.65 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  34.11 
 
 		 228 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  34.11 
 
 		 228 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.84 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.19 
 
 		 230 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.64 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.1 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.12 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.48 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.01 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  26.95 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  35.61 
 
 		 228 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.28 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.61 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  33.94 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  33.99 
 
 		 231 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.83 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.61 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.7 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  31.1 
 
 		 226 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  28.96 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  34.31 
 
 		 232 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>