274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0494 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 336 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.38 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  56.51 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  54.14 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  51.82 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.24 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.94 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  47.28 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.53 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.45 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  28.4 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.49 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.73 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.45 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.51 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.43 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.69 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.64 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  26.18 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.03 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.55 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.39 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  25.91 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.74 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  27.67 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.98 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.88 
 
 		 347 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  27.8 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  25.75 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  27.6 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  29.14 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  27.78 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25.16 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  30.52 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.03 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.19 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.74 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.44 
 
 		 352 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.72 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.31 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.36 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.39 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  24.07 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  31.72 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  25.83 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  27.73 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  24.56 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  28.26 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  28.82 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  26.41 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  32.97 
 
 		 1084 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  27.67 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.37 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 1078 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  24.77 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.65 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2452  hypothetical protein  24.75 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.271591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  24.75 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.55 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  24.93 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  27.84 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  23.93 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1479  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.124132  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.99 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  24.27 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.78 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.16 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.85 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.55 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  26.99 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.23 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  26.98 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.42 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.49 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  24.32 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.256195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.95 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3021  transcriptional regulator protein  27.1 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.140247  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0351  hypothetical protein  26.57 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.49 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  23.75 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  21.77 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  26.19 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  25.39 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.78 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  23.44 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  19.51 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>