50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0810 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  58.54 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  59.61 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  51.86 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  36.07 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  35.74 
 
 		 349 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  34.27 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  32.92 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  34.53 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  31.55 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  32.27 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  32.24 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  33.03 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  31.7 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  30.03 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  33.22 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  28.53 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  28.08 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  29.02 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  31.46 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  31.21 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  28.1 
 
 		 343 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  29.71 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  27.16 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  25.96 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  25.58 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  25.58 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3747  hypothetical protein  29.22 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  25 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  26.98 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  22.66 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  43.08 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  43.08 
 
 		 201 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  43.08 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  43.08 
 
 		 185 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  37.21 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.55 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  32.58 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.75 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  22.54 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.53 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.65 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  25.08 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  19.53 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.85 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.62 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>