39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1766 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1766  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 363 aa  747    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.863879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  30.06 
 
 		 331 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  30.94 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  29.18 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  29 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  28.95 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  31.99 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  27.99 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  29.07 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  28.92 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  28.23 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  28.31 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  27.7 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  26.2 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  24.7 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  24.92 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  26.43 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  26.45 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  25.16 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  24.69 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  25.96 
 
 		 329 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3942  hypothetical protein  25.93 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3817  hypothetical protein  25.93 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3744  hypothetical protein  25.93 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  25.66 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1398  hypothetical protein  24.17 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.960622  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  23.92 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02534  transcriptional factor  24.24 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  23.99 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1381  transcription factor  24.64 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00306961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.65 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  20.71 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.26 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.24 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0945  putative transcription factor  25.27 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000235014 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  22.06 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.94 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  22.36 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>