33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0194 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0173  transcriptional factor-related protein  100 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0198  transcriptional factor-related protein  94.59 
 
 		 187 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5054  transcriptional factor-related protein  81.62 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2212  transcriptional factor-related protein  43.68 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.555677  normal  0.42409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2541  transcriptional factor-related protein  42.25 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3176  hypothetical protein  42.25 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2026  transcriptional factor-related protein  45.93 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  55.29 
 
 		 343 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0288  transcriptional factor MdcH  51.32 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.727683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2191  transcriptional factor MdcH  34.65 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.073233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  36.19 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  34.95 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  40.28 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  38.37 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0371  transcriptional regulator-like protein  44.93 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1304  transcriptional regulator-like protein  36.25 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4097  transcriptional regulator-like protein  36.25 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1474  transcriptional regulator-like protein  37.14 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0810  hypothetical protein  43.08 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1055  hypothetical protein  42.25 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1323  hypothetical protein  42.25 
 
 		 383 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1283  transcriptional regulator-like protein  42.86 
 
 		 333 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  40.68 
 
 		 349 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  35.92 
 
 		 336 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1400  hypothetical protein  46.48 
 
 		 355 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157515  hitchhiker  0.00264584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  42.86 
 
 		 338 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4575  hypothetical protein  37.33 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  41.89 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2035  transcriptional regulator-like protein  27.94 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.754557  normal  0.0891435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  35.06 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001847  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  32.47 
 
 		 152 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>