191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  668    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  46.33 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  45.18 
 
 		 329 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  41.21 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  41.52 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  41.35 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  41.3 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  40.48 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  42.04 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  41.01 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 675 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  37.43 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  38.01 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  38.46 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  38.48 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  37.58 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  37.01 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  39.34 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  36.83 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 683 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.5 
 
 		 663 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  36.28 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  34.85 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  33.96 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  34.55 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  34.55 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  36.76 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  29.34 
 
 		 663 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  33.54 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  32.06 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  33.22 
 
 		 664 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  32.22 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.66 
 
 		 699 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  31.76 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  29.03 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  31.76 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  30.9 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.63 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.99 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  30.47 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  38.39 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  26.21 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.91 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.67 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  23.9 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.57 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  20 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.77 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.2 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.72 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.09 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.49 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.18 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.51 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  26.23 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  28.05 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.17 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.62 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.71 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  22.66 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  32.32 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.72 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.28 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.75 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3521  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.84 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.13 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  24.23 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.48 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  22.66 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.43 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.36 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.3 
 
 		 303 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  28.5 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  21.7 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  22.27 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  22.27 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.7 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.53 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.7 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  34.19 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  24.35 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  31.08 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  30.81 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.1 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  26.34 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.08 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.17 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  28.02 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>