281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1771 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  100 
 
 		 675 aa  1320    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  65.95 
 
 		 683 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.26 
 
 		 663 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  34.11 
 
 		 663 aa  289  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 331 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  51.71 
 
 		 318 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  48.2 
 
 		 329 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  47.84 
 
 		 318 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  49.22 
 
 		 313 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  49.34 
 
 		 319 aa  250  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  45.1 
 
 		 361 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  48.45 
 
 		 315 aa  243  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  47.63 
 
 		 323 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  46.67 
 
 		 327 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  46.5 
 
 		 327 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  47 
 
 		 327 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  44.17 
 
 		 344 aa  230  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  44.41 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  46.04 
 
 		 335 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  43.47 
 
 		 361 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  45.12 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  44.89 
 
 		 325 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  44.21 
 
 		 323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  42.9 
 
 		 326 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  41.69 
 
 		 321 aa  211  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  46.06 
 
 		 330 aa  210  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  45.06 
 
 		 321 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  42.34 
 
 		 332 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  41.46 
 
 		 335 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  42.32 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  44.31 
 
 		 327 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  42.59 
 
 		 337 aa  197  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  42.15 
 
 		 331 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  39.69 
 
 		 361 aa  191  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  38.99 
 
 		 364 aa  191  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  41.94 
 
 		 340 aa  188  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  37.24 
 
 		 343 aa  187  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  38.79 
 
 		 337 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  38.54 
 
 		 320 aa  183  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  39.58 
 
 		 331 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  38.94 
 
 		 317 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  40.3 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  37.42 
 
 		 325 aa  170  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  37.42 
 
 		 325 aa  170  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  41.36 
 
 		 348 aa  168  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  38.36 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  36.2 
 
 		 325 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  38.89 
 
 		 325 aa  158  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  35.31 
 
 		 328 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  35 
 
 		 331 aa  152  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  36.53 
 
 		 334 aa  151  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  34.3 
 
 		 316 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  34.73 
 
 		 326 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  37.72 
 
 		 330 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 664 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  37.31 
 
 		 326 aa  137  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  38.06 
 
 		 324 aa  136  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  33.55 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  40.34 
 
 		 334 aa  130  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  32.01 
 
 		 699 aa  120  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.84 
 
 		 687 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  34 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  29.45 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.76 
 
 		 351 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  28.62 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  30.38 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  30.28 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  30.06 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.75 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.27 
 
 		 318 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  25.91 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  31.35 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.35 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.35 
 
 		 317 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.55 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.23 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  26.73 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  25.35 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.81 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  23.24 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.62 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.2 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.14 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.51 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2449  helix-turn-helix, type 11  28.99 
 
 		 229 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.153287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  27.44 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  29.67 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.51 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.12 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>