200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2434 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  48.91 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 683 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  45.32 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  47.09 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  45.15 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  44.24 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  45.05 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  44.44 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 675 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  46.27 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  43.64 
 
 		 327 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  40.12 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  40.47 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  38.97 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  40.96 
 
 		 326 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  40.96 
 
 		 326 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  39.47 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  39.7 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  39.63 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  38.21 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  40.12 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  38.35 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  38.21 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  39.17 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  38.7 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  37.92 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  35.19 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  37.91 
 
 		 663 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  36.97 
 
 		 663 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 664 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  32.43 
 
 		 699 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.37 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.56 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.22 
 
 		 687 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.24 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.78 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.44 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  28.22 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.18 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  31.63 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.35 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.25 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  28.57 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.48 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  29.28 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  23.74 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.4 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.74 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  24.31 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  27.33 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.71 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.23 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.15 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  27.15 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.15 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.09 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.67 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.39 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  29.63 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.66 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.66 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.63 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  30.37 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.53 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.27 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  30.94 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.68 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  26.21 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.56 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  25 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  29.17 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.26 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.33 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.39 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.26 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.19 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.46 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.13 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.86 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.95 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.31 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25.22 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.25 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.22 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>