213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  62.81 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  53.27 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  53.72 
 
 		 340 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  52.51 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  50.31 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  50.32 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  51.18 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  47.42 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  47.63 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  47.71 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  45.96 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  45.96 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  45.65 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  47.48 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  45.65 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  47.5 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  44.06 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  48.12 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  49.04 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  47.95 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  42.9 
 
 		 675 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  41.3 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  44.9 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  43.32 
 
 		 683 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  38.91 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.37 
 
 		 663 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  33.65 
 
 		 663 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  37.41 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  38.14 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  41.55 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  34.74 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  31.46 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  32.14 
 
 		 368 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.53 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  30.53 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  32.19 
 
 		 369 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.99 
 
 		 367 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.4 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.63 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  31.46 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.43 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  30.47 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  29.89 
 
 		 664 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.51 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  30.8 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  29.6 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  25.96 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  22.3 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  31.25 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.9 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  22.69 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.78 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  30.66 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.11 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  24.85 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.17 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  28.41 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.93 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.54 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  23.48 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  20.38 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.09 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.62 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.22 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  24.55 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.19 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.66 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  31.14 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.72 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  28.41 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.43 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.08 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.91 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.69 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.61 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.94 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.84 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  29.03 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.11 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.73 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6012  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.76 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.72 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.36 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  21.23 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  20.94 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.77 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.64 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.7 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.62 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.83 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>