205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3092 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 328 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  92.24 
 
 		 331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  83.49 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  83.49 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  82.87 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  70.83 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  50.94 
 
 		 321 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  48.02 
 
 		 326 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  47.35 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  48.32 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  49.01 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  43.33 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  47.35 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  44.55 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  41.9 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  41.49 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  39.51 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  41.05 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  39.31 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  40.37 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  38.72 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  38.63 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  36.28 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 675 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  32.92 
 
 		 663 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  32.8 
 
 		 663 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  36.76 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  34.78 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  32.88 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  34.43 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 683 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  32.46 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.31 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  28.75 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  28.02 
 
 		 699 aa  83.2  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  24.04 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.48 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.49 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.51 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  26.88 
 
 		 687 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  31.3 
 
 		 664 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.15 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  26.75 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  26.75 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  26.62 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  25.85 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.35 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  27.59 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.78 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.72 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.23 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.45 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.73 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.16 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.08 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.94 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  27.89 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  18.55 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.86 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  29.17 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.38 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4185  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.46 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  21.79 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  21.02 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  21.02 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.27 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  30.99 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  21.62 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  24.34 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.6 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  27.08 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.27 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.32 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.09 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.69 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  24.6 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  28.34 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.71 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  29.95 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.4 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.65 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.37 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.66 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  28.48 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.58 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.79 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.57 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  19.94 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.68 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.8 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  27.7 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>