259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2435 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  52.87 
 
 		 318 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  48.25 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  50.87 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  48.01 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  51.1 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  47.78 
 
 		 675 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  48.12 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  45.28 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  46.53 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  46.39 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  45.97 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  46.1 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  43.89 
 
 		 683 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  43.53 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  40.68 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  39.5 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  39.5 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  38.75 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  38.87 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  38.48 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  41.16 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  38.99 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  37.54 
 
 		 663 aa  175  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  36.62 
 
 		 663 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  42.09 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  39.13 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  36.14 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  41.73 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  39.04 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.91 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.87 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.44 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.04 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  30.19 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.22 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.13 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  30.55 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  23.4 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.7 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  29.46 
 
 		 664 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  28.99 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  23.25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.03 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  23.4 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.32 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.49 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  29.75 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  30.38 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  24.46 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.32 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.31 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  29.43 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.5 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  24.67 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  24.92 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.22 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  20.13 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  25.76 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  25.76 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  24.67 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  25.76 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  24.52 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.29 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.64 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.66 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  25.76 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.54 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.29 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.43 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.19 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  24.46 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  24.41 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  24.44 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  23.29 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.24 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.78 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.87 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  24.11 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  25.66 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  24.09 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  24.46 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.78 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  18.73 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.6 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.13 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  22.36 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  27.66 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>