211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11950 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
699 aa  1319    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  29.29 
 
 
663 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  30.09 
 
 
663 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  32.16 
 
 
675 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  29.67 
 
 
683 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  36.92 
 
 
327 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 
361 aa  117  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  36.8 
 
 
337 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  37.69 
 
 
327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  35.09 
 
 
326 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 
348 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  35.09 
 
 
326 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  35.09 
 
 
326 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  35 
 
 
337 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  33.1 
 
 
335 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  34.22 
 
 
329 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  28.67 
 
 
664 aa  107  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  33.45 
 
 
359 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  34.44 
 
 
340 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  33.07 
 
 
352 aa  105  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  35 
 
 
335 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  34.27 
 
 
354 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  35.86 
 
 
315 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  35.56 
 
 
327 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  34.27 
 
 
318 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  31.64 
 
 
332 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
331 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  33.85 
 
 
313 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  31.27 
 
 
323 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  36.07 
 
 
320 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  33.88 
 
 
326 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  31.86 
 
 
325 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  34.04 
 
 
364 aa  95.5  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  34.94 
 
 
330 aa  94.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  32.99 
 
 
361 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  30.51 
 
 
321 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  31.23 
 
 
325 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  32.27 
 
 
327 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  32.76 
 
 
317 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  33.77 
 
 
344 aa  89  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  30.63 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  30.63 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  30.79 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  32.44 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  30.67 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  31.66 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  28.77 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  31.9 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  30.22 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  29.2 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  28.95 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  27.35 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  29.91 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.12 
 
 
347 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  34.34 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  29.6 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.85 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  32.04 
 
 
326 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  22.49 
 
 
304 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
322 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  37.08 
 
 
336 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  24.46 
 
 
301 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  30.14 
 
 
323 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.78 
 
 
324 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.73 
 
 
315 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
333 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  43.9 
 
 
316 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.77 
 
 
319 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  31.93 
 
 
334 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.62 
 
 
318 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.21 
 
 
319 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.68 
 
 
341 aa  57.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.4 
 
 
351 aa  57.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  28.29 
 
 
323 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.14 
 
 
324 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  34.9 
 
 
241 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.45 
 
 
317 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.73 
 
 
339 aa  55.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.86 
 
 
327 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  32.45 
 
 
316 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.58 
 
 
327 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  28.99 
 
 
322 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  27.59 
 
 
230 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.17 
 
 
351 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  27.59 
 
 
230 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.02 
 
 
316 aa  54.3  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.15 
 
 
298 aa  53.9  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.81 
 
 
319 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  27.59 
 
 
230 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.76 
 
 
334 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  31.76 
 
 
229 aa  53.9  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.67 
 
 
324 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.4 
 
 
317 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.79 
 
 
233 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.92 
 
 
237 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.18 
 
 
327 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.98 
 
 
335 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  29.7 
 
 
350 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>