More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2367 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
313 aa  636    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.14 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  33.22 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  33.12 
 
 
311 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.84 
 
 
302 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.27 
 
 
322 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  25.56 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.86 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.65 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.34 
 
 
307 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  24.84 
 
 
306 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  33.65 
 
 
230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  33.49 
 
 
230 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  33.49 
 
 
230 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.22 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.82 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  31.95 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.55 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3980  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.77 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.52 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.34 
 
 
324 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.61 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.67 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.79 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.97 
 
 
232 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.42 
 
 
230 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.97 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.33 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  29.87 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.87 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.97 
 
 
232 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.49 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.42 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  36.32 
 
 
237 aa  85.9  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.21 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.16 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  32.88 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.38 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.51 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.18 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.06 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.33 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  33.01 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  31.16 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.47 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.1 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.04 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2449  helix-turn-helix, type 11  33.82 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.153287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.25 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.01 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.22 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  27.95 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  31.66 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.7 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1078  transcriptional regulator  37.38 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0823  hypothetical protein  28.04 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2933  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.61 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  32.54 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  30.07 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0875  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.25 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.82 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3341  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.04 
 
 
177 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.93 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.8 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0766  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.63 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.5 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.56 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  29.58 
 
 
238 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.28 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.5 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.87 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.14 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.3 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  28.31 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  29.5 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.67 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.6 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.48 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.5 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>