228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0608 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 364 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  94.26 
 
 		 367 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  99.35 
 
 		 369 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  83.96 
 
 		 368 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.23 
 
 		 663 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  35.85 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  33.75 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  34.37 
 
 		 321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  32.91 
 
 		 326 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  31.09 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  33.44 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  31.7 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  29.12 
 
 		 663 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  33.89 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 675 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  31.06 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.86 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  31.56 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  31.88 
 
 		 319 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.61 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  28.95 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  31.78 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  32.23 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  30.77 
 
 		 687 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  29.41 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 683 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  31.82 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  28.71 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  31.43 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  31.17 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  28.23 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  28.23 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  27.33 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  31.42 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  27.89 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  29.54 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.31 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  28.83 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.3 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  27.33 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.34 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.88 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.26 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  30.98 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  36.84 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.71 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.08 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.45 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  30.06 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.77 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  22.92 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.37 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.74 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.73 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.68 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  32.07 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  33.66 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.55 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  26.28 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  28.16 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25.81 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  25.81 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  27.78 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.52 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  24.92 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.04 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.67 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  24.68 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  41.03 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  41.25 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  46.67 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.42 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  21.24 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.99 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.12 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  30 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  28.34 
 
 		 332 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.52 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  21.5 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.06 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  28.81 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  24.52 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  46.67 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.35 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.85 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  24.88 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.256195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>