250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5785 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 
687 aa  1366    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  27.47 
 
 
683 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.1 
 
 
369 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  24.96 
 
 
663 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  28.91 
 
 
318 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  30.12 
 
 
313 aa  99.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 
348 aa  96.3  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  30.3 
 
 
335 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  24.19 
 
 
663 aa  94.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  29.36 
 
 
359 aa  94  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  26.78 
 
 
330 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  26.99 
 
 
675 aa  88.6  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
331 aa  88.2  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  30.77 
 
 
337 aa  87.4  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  28.01 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.22 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  28.01 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  31.84 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  28.31 
 
 
326 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  27.6 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.23 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  26.96 
 
 
330 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  28.02 
 
 
331 aa  79.7  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  28.79 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  29.01 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  29.43 
 
 
326 aa  79  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  31.76 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.71 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.6 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.04 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  33.14 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  28.02 
 
 
335 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  28.17 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  27.91 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  27.98 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  28.26 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  25.23 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.65 
 
 
327 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  25.22 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.47 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  34.23 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  30.42 
 
 
352 aa  72  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  26.11 
 
 
321 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  28.69 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  29.75 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  27.53 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  33.56 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  28.39 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  27.42 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.91 
 
 
337 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.41 
 
 
317 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.65 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.89 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.48 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  29.07 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  32.02 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  30.03 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  27.5 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  26.65 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.02 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  27.76 
 
 
325 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  27.76 
 
 
325 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  27.44 
 
 
326 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  27.42 
 
 
319 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  28.17 
 
 
345 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  28.94 
 
 
317 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.47 
 
 
334 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 
322 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.25 
 
 
319 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  28.99 
 
 
344 aa  64.3  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.55 
 
 
327 aa  63.9  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  28.45 
 
 
320 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.05 
 
 
327 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.38 
 
 
323 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.52 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  27.22 
 
 
321 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  29.8 
 
 
336 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  29.71 
 
 
326 aa  62  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  31.68 
 
 
324 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  24.44 
 
 
325 aa  61.6  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  27.09 
 
 
334 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  27.19 
 
 
331 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  28.08 
 
 
318 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  25.65 
 
 
349 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  30.08 
 
 
364 aa  61.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
230 aa  60.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.9 
 
 
323 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  30.49 
 
 
324 aa  60.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  25.88 
 
 
317 aa  60.8  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  24.85 
 
 
334 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  27.37 
 
 
237 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.14 
 
 
336 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  26.85 
 
 
336 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  34.12 
 
 
327 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.87 
 
 
315 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>