192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3444 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  83.89 
 
 		 359 aa  550  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  77.23 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  77.23 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  77.23 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  70.34 
 
 		 332 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  53.47 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  50.61 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  49.55 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  46.3 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  45.73 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  44.21 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  45.02 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  45.14 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  42.33 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 683 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  43.67 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  44.16 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  43.56 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  39.14 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  40.36 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  41.59 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  38.86 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  39.88 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  40.12 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  38.11 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 675 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  40.55 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  39.26 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  39.82 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  36.5 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  38.51 
 
 		 663 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  37.65 
 
 		 663 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  30.3 
 
 		 687 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  34.3 
 
 		 664 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  33.1 
 
 		 699 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  30.52 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.23 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  27.52 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.86 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  28.13 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  27.27 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.41 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.17 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.9 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  25.54 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.88 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  32.42 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.42 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.59 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.94 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  29.28 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.12 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.15 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  32.98 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.97 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.28 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.48 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.19 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.72 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.54 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.74 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.14 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  31.13 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.91 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.72 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.81 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.87 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  22.22 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.83 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.67 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.82 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  26.1 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  29.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.28 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.21 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.68 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.41 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  28.65 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  31.69 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.12 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.12 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  25.86 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.02 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>