278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0623 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
335 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  81.79 
 
 
334 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  81.19 
 
 
334 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  81.19 
 
 
334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  36.04 
 
 
512 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  38.62 
 
 
511 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  35.94 
 
 
369 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  38.14 
 
 
345 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  38.44 
 
 
511 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.9 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  30.32 
 
 
687 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 
312 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  31.42 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  30.8 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.22 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  30.99 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.97 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  29.65 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  31.39 
 
 
683 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.78 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  24.32 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.68 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  31.87 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  25.3 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.45 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.95 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  24.02 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  34.09 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.86 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.56 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  30.8 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.99 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  33.19 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  33.05 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  32.75 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  30.93 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.93 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  29.63 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  32.79 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  41.25 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  32.54 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  32 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  28.45 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  30.22 
 
 
663 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  30.7 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  37.32 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  24.4 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  29.76 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.79 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  30.9 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.47 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  31.82 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.59 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  32.69 
 
 
663 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  26.65 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.3 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  32.02 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.75 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  42.86 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
234 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  24.85 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  44.62 
 
 
675 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  36.48 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  26.73 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  28.76 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  30.7 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  23.39 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  28.4 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  30.77 
 
 
327 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.55 
 
 
324 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.53 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3521  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.6 
 
 
231 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.38 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  30.52 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  29.69 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.38 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  24.88 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  26.82 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  22.26 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  32.98 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.77 
 
 
237 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  23.19 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30 
 
 
229 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.92 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.74 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  28.46 
 
 
231 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  28.75 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  28.75 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  28.75 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.64 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  24.39 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.76 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.96 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.32 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>