136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4015 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 
512 aa  1003    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  57.86 
 
 
511 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  61.84 
 
 
511 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  65.8 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
335 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  36.01 
 
 
334 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  35.58 
 
 
334 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
334 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.12 
 
 
369 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  34.32 
 
 
337 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  32.47 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  33.5 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.32 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.55 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  30.17 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
331 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.77 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.55 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.33 
 
 
324 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  24.5 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  27.3 
 
 
683 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.26 
 
 
326 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  30.52 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.02 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.16 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.23 
 
 
687 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  27.27 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  31.09 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  28.22 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  29.05 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  30.25 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  28.31 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  25.55 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.5 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  25.55 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  25.55 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  30.38 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  29.6 
 
 
325 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.75 
 
 
336 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.13 
 
 
312 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  32.02 
 
 
352 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  29.91 
 
 
320 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  26.01 
 
 
361 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.51 
 
 
351 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  25.75 
 
 
334 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.6 
 
 
339 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.17 
 
 
327 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  31.49 
 
 
327 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  25.84 
 
 
335 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  30.61 
 
 
327 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.6 
 
 
350 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  27.76 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  26.73 
 
 
663 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  30.86 
 
 
675 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.16 
 
 
334 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  22.74 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
347 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  29.39 
 
 
330 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.01 
 
 
319 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.56 
 
 
313 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.85 
 
 
336 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.57 
 
 
317 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  26.89 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.89 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  29.74 
 
 
344 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  34.13 
 
 
323 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  30.54 
 
 
663 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.48 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  27.89 
 
 
401 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  24.91 
 
 
326 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  28.36 
 
 
348 aa  53.9  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  49.06 
 
 
316 aa  53.5  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.56 
 
 
319 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.6 
 
 
318 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  30.08 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  27.51 
 
 
325 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  29.66 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3902  hypothetical protein  35.83 
 
 
221 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4003  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.83 
 
 
221 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.83 
 
 
221 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.43 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.91 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.08 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  25.85 
 
 
229 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  22.79 
 
 
323 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  20.97 
 
 
326 aa  50.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  25.29 
 
 
331 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  25.13 
 
 
326 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.88 
 
 
313 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.65 
 
 
321 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.65 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  29.36 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  25.46 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.15 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  31.48 
 
 
323 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  26.36 
 
 
334 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.42 
 
 
232 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.18 
 
 
333 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>